1980 yılında Los Angeles’ta doğmuş olan Zooey Deschanel’ın babası Oscar’a aday olmuş bir sinema fotoğrafçısı, annesi ise ünlü dizi İkiz Tepeler‘de oynamış bir aktrist. Böyle bir aileden gelmesi sayesinde erken yaşlarda oyunculuk kariyerine başlayan Zoe, ilk rolünü “Veronica’s Closet (1997)” adlı sitkom dizisinde bir modeli canlandırarak almıştır. İlk filmi Mumford (1999)’da oynayabilmek ve tam zamanlı aktistlik yapabilmek için üniversiteyi yarıda bırakmıştır. Daha sonra Cameron Crowe’un ünlü filmi Almost Famous (2000)’da rol almasıyla oyunculuk kariyeri atağa geçmiştir. David Gordon Green’in All the Real Girls (2003) adlı filmdeki oyunculuğuyla, Mar Del Plata Film Festivali’nde en iyi kadın oyuncu ödülünü almıştır.
Onun bizler tarafından tanınması ise Douglas Adams’ın ünlü yapıtından uyarlanan The Hitchhiker’s Guide to the Galaxy (Otostopçunun Galaksi Rehberi) adlı filmdeki Trillian karakteri olmuştur.